* Koç Üniversitesi Fen ve Mühendislik Bilimleri Enstitüsü Tezli Yüksek Lisans ve Doktora Programları kapsamında farklı burs olanakları bulunmaktadır. Tezsiz Yüksek Lisans Programları ise ücrete tabidir.
** Fen ve Mühendislik Bilimleri Enstitüsü tüm Yüksek Lisans Programlarının Tezli ve Tezsiz Yüksek Lisans seçenekleri bulunmaktadır.
*** Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik, Bilgisayar Bilimleri ve Mühendislik, Malzeme Bilimleri ve Mühendislik, Optoelektronik ve Fotonik Mühendisliği Tezsiz Yüksek Lisans Programları için Yükseköğretim Kurulu tarafından onaylanması koşuluyla öğrenci alınacaktır.
Kuruluşundan bu yana hızlı bir büyüme göstermiş olan enstitüde, alanında dünya çapında ün yapmış ve ödüllü birçok öğretim görevlisi çalışmalarına devam etmektedir. Enstitü, Nanomalzeme, Biyoteknoloji, Biyoenformatik, Sürdürülebilir Enerji, Sistem Mühendisliği ve Sistem Biyolojisi, İlaç Tasarımı, Sinyal İşleme, Optik, Telekomünikasyon, Elektromanyetik, Nanoteknoloji, Robotik, Mekatronik, Biyomekanik, Fotonik, Kuantum Fiziği, Kombinatorik ve Çizge Kuramı, Topoloji gibi geniş uygulama alanlarına sahip konularda araştırmalarına devam etmektedir. Fen Bilimleri Enstitüsü, günümüzün teknolojik ve bilimsel ihtiyaçlarını göz önünde bulundurarak giderek büyüyen akademik yelpazesiyle eğitime hizmet vermeyi hedeflemektedir.